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新型コロナウイルス感染症に関する可視化情報等の個人的なまとめ

covid19_memo

新型コロナウイルス感染症に関する可視化情報等の個人的なまとめです。

このリポジトリはGitHub Pagesを用いることで、以下アドレスでWebサイトとして公開されています。

新型コロナウイルス感染症に関する可視化情報等の個人的なまとめ

あくまで個人的なまとめで、内容に対して保証などするものではありません。

以下GitHubリポジトリの内容と連動しています。PR歓迎します。

GitHub:karaage0703/covid19_memo

可視化情報

Japan

特定地域

東京都内の最新感染動向(GitHub:tokyo-metropolitan-gov/covid19)
東京都発信。GitHubでOSSとして公開され、活発に開発が行われている。東京都のGitHubリポジトリをforkして、各都道府県のサイトが立ち上がっている

東京都のサイトから派生した各都道府県の最新感染動向
東京都のリポジトリからforkされた各都道府県サイトの一覧

以下は、個人的に気にしている都道府県の感染動向へのリンク(その他は、上記のリンク先を参照)

愛知県内の最新感染動向(GitHub:code4nagoya/covid19)
三重県内の最新感染動向(GitHub:FlexiblePrintedCircuits/covid19-mie)

新型コロナウイルス対策サイト立ち上げのための技術的情報

東京都 新型コロナウイルス対策サイトへの貢献方法を解説
新型コロナウイルス対策サイトのGitHubリポジトリへのPRの具体的な手順

COVID-19-mieのためのスクレイピング+自動更新プログラムを書いた
三重の感染動向サイトを立ち上げた際の経緯や技術的内容を三重県の高専生が発信

岡山県版新型コロナウイルス対策サイトを開発・運用している話
岡山の新型コロナウイルス対策サイト開発に関する技術的記事

愛知県コロナ対策サイト(非公式)公開までの4日間
愛知県の新型コロナ対策サイトの開発の経緯

大学生が山口県版新型コロナウイルス対策サイトの立ち上げ, 運用, 県との交渉をしてみた
山口県の新型コロナウイルス対策サイト開発に関しての記事

国内全体

新型コロナウイルス国内感染の状況(GitHub:kaz-ogiwara/covid19)
東洋経済発信。みやすく国内のデータが一目で把握できる

新型コロナウイルスの事例マップ
事例ごとに日本地図にマッピングされている

都道府県別新型コロナウイルス感染者数マップ
ジャッグジャパン株式会社提供。国内のデータを可視化

新型コロナウイルス 日本国内の最新感染状況マップ
国内のデータを可視化

特設サイト コロナウイルス(NHK)
NHK発信。国内のデータを可視化

Japan COVID-19 Coronavirus Tracker(GitHub:reustle/covid19japan)
個人の発信。国内のデータを可視化

新型コロナウィルス 国内感染状況(GitHub:mazarimono/chomoku)
個人の発信。国内のデータを可視化。ネットワーク図で人同士の繋がりがみられるのが特徴。技術的な内容はQiita記事参照

新型コロナウイルス感染速報(GitHub:swsoyee/2019-ncov-japan)
個人の発信。厚生労働省の情報をもとに可視化。情報量多くみやすい

新型コロナウイルス対策ダッシュボード(GitHub:code4sabae/covid19)
Code for Sabae発信。オープンデータを活用して、日本全国の情報を可視化

都道府県別 感染症病床数(GitHub:code4sabae/bedforinfection)
Code for Sabae発信。感染症病ベッド情報を公開中

新型コロナウィルス Covid-19 全国公式データ一覧
個人発信。全国の公式データのリンクまとめ

SIGNATE COVID-19 Dashboard
SIGNATEのCOVID-19チャレンジ(フェーズ1)から生まれたダッシュボード

新型コロナ 県別・時系列グラフ
個人発信。正しく検査数、陽性者数を把握したい場合はここが良さそう

Rt Covid-19 Japan
個人発信。都道府県ごとの実効再生産数(感染性の指標, Rt)の変化を可視化

World

新型コロナ感染世界マップ
日経新聞発信。みやすく世界の情報が可視化されている

COVID-19 Coronavirus Map(GitHub:stevenliuyi/covid19)
世界のデータを可視化。みやすい

SARS-CoV-2 (BNO News / BNO Noticias Coronavirus tracker)
Google Map上に感染者が可視化されている

Coronavirus Tracker(GitHub:JohnCoene/coronavirus)
世界のデータを可視化。スマホでみやすいインターフェース

Coronavirus Map: Tracking the Spread of the Outbreak(New York Times)
New York Times発信。日本の感染者数はクルーズ船が含まれているので注意

COVID-19 CORONAVIRUS OUTBREAK
世界のデータを可視化。みやすい

新型コロナウイルスの国別感染者数(中国以外)
時系列でアニメ的に感染状況を表示

Coronavirus COVID-19 Global Cases by Johns Hopkins CSSE
ジョン・ホプキンス大学発信。情報のアップデートが速い

Databrew’s COVID-19 data explorer
データコンサルタントのdatabrew発信。新型コロナウイルスの流行の勢いを国別で可視化・比較できる。詳細は、Gigazineの記事参照

Covid Trends
国別の感染の広がり方を、時系列のグラフで可視化

データ分析・可視化結果

Kaggle

 Kaggleでデータ分析をしている例。Pythonで分析・可視化する際の参考になる。

COVID-19 - Analysis, Viz, Prediction & Comparisons

Coronavirus (COVID-19) Visualization & Prediction

Novel Coronavirus: EDA & Forecast Number of Cases

Tableau

 Tableauでの可視化した結果。

CoronaVirusDashboard

2020 Corona Virus in the United States

CORONA19Map

tableau search results

SIGNATE #COVID19 Cases Dashbord

自分のデータ分析

 自分が実施したデータ分析の結果。

新型コロナウイルス感染症(COVID-19)のオープンデータをGoogle Colaboratoryで手軽に可視化・分析する方法
Qiitaへの投稿記事。Google Colabを使った分析の手順

covid19_visualization.ipynb
オープンデータとして公開されているGoogle Spread Sheetを用いた分析

covid19_visualization_json.ipynb
日本全国の感染動向可視化動向の可視化サイトのjson形式データを用いた分析

signate_covid_19.ipynb
SIGNATEのCOVID-19チャレンジ(フェーズ1)の成果物として公開されたオープンデータ(Google Spread Sheet)を用いた分析

その他

 その他、メディアや個人でのデータ分析の紹介。

Coronavirus Disease (COVID-19) – Statistics and Research
感染状況の統計的な分析記事

GitHub:twiecki/covid19
感染状況を可視化しているJupyter Notebook

personal-hm2/coronavirus_model
PFNの丸山さんが、新型コロナウイルスの流行予測のモデル化をしたJupyter Notebook。

データ分析のコンペティション

COVID19 Global Forecasting (Week 1)
感染拡大を予想するKaggleのコンペ(世界版)

COVID19 Local US-CA Forecasting (Week 1)
感染拡大を予想するKaggleのコンペ(USローカル版)

AI4D Predict the Global Spread of COVID-19
感染拡大を予想するZindi(アフリカ)のコンペ

COVID-19チャレンジ(フェーズ1)
SIGNATE(日本)のCOVID-19に関するコンペ。初回のフェーズ1では、オープンデータの整備を目的に開催

COVID-19チャレンジ(フェーズ2)
SIGNATE(日本)のCOVID-19に関するコンペ。フェーズ1で成果として得られたオープンデータを使ったデータ分析を実施

オープンデータ

 オープンデータとして公開されているCOVID-19関連データ。

COVID19Japan.com Data(Spredsheet)
Google スプレッドシートでオープンデータとして公開

東洋経済 csvデータ
東洋経済が公開しているオープンデータ

Novel Corona Virus 2019 Dataset(kaggle)
Kaggleのデータセットとして公開

COVID-19 Complete Dataset (Updated every 24hrs)(kaggle)
Kaggleのデータセットとして公開

COVID-19 Open Research Dataset Challenge (CORD-19)
米ホワイトハウスらが、Kaggleで提供。COVID-19に関する研究論文を集めたデータ。

【新型コロナ】県別の検査数の推移
個人発信。Googleデータポータルを使ってオープンデータを可視化

GitHub:ieee8023/covid-chestxray-dataset
医療機関発信。X線写真、CT写真のデータセット。写真からCOVID-19を判別するための教師データとして使用する

COVID-19 Dashboards(GitHub:github/covid19-dashboard)
GitHub発信。fastpagesをforkして作られているページ。新型コロナウイルスに関するデータのダッシュボード

COVID-19(csv)
ジャッグジャパン株式会社さんが、都道府県別新型コロナウイルス感染者数マップに付随するデータとしてオープンデータとして公開。マップならびにデータへのリンクにCSVへのリンクあり

SIGNATE COVID-2019 Dataset(Spreadsheet)
SIGNATEのCOVID-19チャレンジ(フェーズ1)の成果物としてオープンデータとして公開されたスプレッドシート

GitHub:2019 Novel Coronavirus COVID-19 (2019-nCoV) Data Repository by Johns Hopkins CSSE
ジョン・ホプキンス大学発信のオープンデータ。csv形式でGitHub上にアップ

COVID-19に関する資料・情報

COVID-19 について
神戸大学の中澤港先生の資料。情報量多め

COVID-19への対策の概念
東北大学大学院医学系研究科の押谷先生の資料。シンプルで分かりやすい資料

新型コロナウイルス感染を理解するためのやさしい生物学(YouTube動画)
YouTubeでの新型コロナウイルスに対する解説動画のプレイリスト

新型コロナウイルスのNow!!
公立陶生病院 感染症内科 武藤 義和先生の資料。2020/07/26時点での最新情報のまとめ

COVID-19対策として提供されている優良サービスまとめ

COVID-19に負けない! 配信、支援サービスリスト (GitHub:tomo-makes/overcome-covid-19-jp)
個人の発信。企業がCOVID-19対策として、無料で配信しているサービスのまとめ

VS COVID-19 企業による支援リスト(GitHub:codeforjapan/supportmenu-vs-covid19)
Code for Japan発信。企業がCOVID-19対策として、無料で配信しているサービスのまとめ

VS COVID-19 #民間支援情報ナビ For 静岡県版(GitHub:hrsano645/vs-covid19)
個人の発信。Code for JapanのVS COVID-19リポジトリをforkして静岡県版を作成

情報をまとめたサイト

Open collaboration on COVID-19
GitHub上にある新型コロナ関係のプロジェクトまとめ。このサイトで紹介しているものも多く含まれている

新型コロナ対策サイトのまとめ
まとめのサイト。このページより情報量多いです

新型コロナウイルス感染症(COVID-19) 統計情報 リアルタイム更新サイトまとめ
個人で、統計情報を中心に集めたサイト

閉鎖したサイト

 公式に一本化する等の理由で閉鎖したサイト。

愛知新型コロナウイルス感染情報(GitHub:code4aichi/corona)
Code for AICHI発信。愛知県での感染状況に加え、感染Mapや人物相関、予防関係のリンクと情報がまとまっていたが、閉鎖し愛知県の情報はCode for Nagoyaの愛知県内の最新感染動向に一本化

大阪府内の最新感染動向
個人発信。東京都のGitHubリポジトリをベースに作られているよう。大阪府が同等のページを立ち上げるということで一本化